Prototype to gra akcji dziejąca się w otwartym na wzór Grand Theft Auto świecie, w której wcielamy się w postać posiadającego nadnaturalne zdolności bohatera wmieszanego w rozległy trwający od wielu lat spisek. Produkcja została opracowana przez firmę Radical Entertainment. Jej wydawcą jest należąca do koncernu Vivendi Games, Sierra Entertainment. W grze wcielimy się w tytułowy prototyp, obdarzonego przez genetyczne eksperymenty nadnaturalnymi zdolnościami człowieka – Aleksa Mercera. Zmiany poczynione w jego genomie doprowadziły do tego, że posiada on zadziwiającą zdolność transformacji własnego ciała. Dzięki temu może przyjmować wygląd napotkanych ludzi. Mało tego, potrafi również przejmować ich wspomnienia i umiejętności. Na tym jednak nie koniec jego mocy. W trakcie starcia może bowiem w ten sposób zmodyfikować swoje ciało, by stało się potężną maszyną do zabijania. Wykształcenie ogromnych szponów czy przyjęcie postaci ogromnego monstrum nie stanowi dla niego większego problemu.